全市轄6鄉5鎮4個街道：金山路街道、解放路街道、團結路街道、恰秀路街道、北屯鎮、阿葦灘鎮、紅墩鎮、切木爾切克鎮、阿拉哈克鎮、喀拉希力克鄉、薩爾胡松鄉、巴里巴蓋鄉、切爾克齊鄉、汗德尕特蒙古族鄉、拉斯特鄉。阿勒泰市是多民族聚居區，聚居著漢、哈薩克、回、維吾爾、蒙古等33個民族。